Pertenecía a la congregación de Agustinos, su construcción fue obra del arquitecto Juan Livingston e inaugurada el 10 de julio de 1870, por el pastor David Trumbull. Fue catedral provisoria, desde la creación del obispado en octubre de 1925, mientras se construía la actual, inaugurada en 1949. El templo desapareció definitivamente en 1972

La primera capilla que se levantó en Valparaíso fue, según benjamín Vicuña Mackenna, una construida en 1559 por Rodrigo González de Marmolejo en el mismo sitio de la matriz. Fue saqueada por Drake en 1578, e incendiada por Spilbergen en 1615.  Sin embargo Vicente Martín y Manero dice que en 1585 esta iglesia ya no existía y que la saqueada por Spilbergen fue otra. En lo que sí hay consenso es que era pobre, de paja y barro.
Poco después, fue construida una segunda iglesia, sencilla pero más elaborada que la anterior que fue destruida por el terremoto de 1730. La tercera iglesia la comenzó a construir el párroco José Pozo y Silva y fue terminada en 1749. Contaba con 2 torres, gruesos muros de adobe y, en su interior, una nave y otras dependencias a los costados. El terremoto de 1751 destruyó una de las torres pero, con algunas modificaciones, sobrevivió 87 años más.
El terremoto de 1822 produjo nuevos daños y la iglesia permaneció en estado ruinoso hasta que en 1837 asumió el párroco José Antonio Riobó quien la demolió. Durante todo este tiempo se siguió usando. Incluso José María Mastai Ferretti, futuro Papa Pío IX, celebró una misa en ella en 1824. Con la venta de los materiales de la demolición y colectas, se construyó la actual iglesia entre 1837 y 1842. Durante el bombardeo de 1866, tres bombas cayeron en la Matriz, pero sin causar grandes daños.
En 1887, el templo estaba en un estado ruinoso, por lo que su párroco Vicente Martín y Manero decide remodelarlo; demuele parte de la torre y redecora todo el interior. Un hecho curioso fue la designación del salvador del mundo como patrono de la matriz. Desde siempre, nuestra Señora de Puerto Claro era venerada popularmente como titular del templo y de la ciudad, pero no había un decreto que la confirmara como tal, y su imagen había desaparecido años atrás. Así, en 1868 se decidió llamar a elecciones, resultando ganador el salvador del mundo, con 19.946 votos.
En 1900, Valparaíso fue consagrado al Sagrado Corazón de Jesús, cuya estatua coronó por mucho tiempo el frontis de la iglesia. A partir de 1971, luego de ser nombrada monumento nacional, la iglesia comienza a ser restaurada. Los terremotos de 1971 y 1985 producen algunos daños, pero son reparados, por lo que hoy está en buen estado de conservación.

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La primera noticia de los mercedarios que se tiene en Valparaíso, data de 1591, año en que compraron a d. Blas Rodríguez la quebrada de Quilmo, actual sector de Portales. Allí construyeron un pequeño hospicio, pero fue abandonado años después.

En 1715, el padre Jerónimo de la Vega adquirió unos terrenos en el Almendral, edificando la primera capilla. Con la venta de varios lotes en los alrededores, se comenzó a poblar el sector. La primitiva iglesia, que miraba hacia el mar, fue destruida por el terremoto y maremoto de 1730. En la misma década, se construye la segunda iglesia. Las fuentes no se ponen de acuerdo de sus características, aunque sufrió daños de consideración con el terremoto de 1751.

En 1778, se inauguró un nuevo templo, más amplio y de ladrillos, que demoró casi una década en construirse y que se derrumbó con el terremoto de 1822. Estaba ubicado en la esquina de Victoria y Uruguay, con el frontis hacia esta última calle.

La cuarta iglesia fue proyectada por el arquitecto Santiago Pringle y también miraba hacia la calle Merced (Uruguay). Poseía muros de ladrillo y adobe y su frontis tenía dos torrecillas. Inaugurada en 1838, a pesar de su poca altura destacaba en el almendral. La iglesia soportó sin problemas el bombardeo de 1866 y los temblores del siglo xix pero, con el tiempo, se fue quedando chica en relación al desarrollo de su barrio.
La quinta iglesia se comenzó a construir en 1887 con el frontis hacia la calle de la Victoria, para no demoler el templo anterior. Fue proyectada y construida por el arquitecto Juan Eduardo Fehrman, inaugurándose en 1893 con el traslado del santísimo y las reliquias de los santos. En 1894 se demuele el viejo templo para construir un edificio de rentas. El terremoto de 1896 produce algunos daños que son reparados.

El gran terremoto de 1906 produce daños de consideración, lo que obliga la posterior demolición de las torres y el altar. En 1946 se inicia la reconstrucción del pórtico y las torres, obras dirigidas por el arquitecto Manuel Valenzuela y que son inauguradas en 1950. Esta vez, la iglesia posee gran presencia urbana debido a la creación de la plaza O'higgins luego del terremoto de 1906. Los movimientos telúricos del siglo xx causaron daños que motivaron su demolición total en 1987, reemplazándose por una iglesia moderna.

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El 3 de mayo de 1868 es colocada la primera piedra de esta iglesia, construcción que estará a cargo de los arquitectos Lucien Henault y Eduardo Fehnman, inaugurada en el año 1874 con su torre aún inconclusa, su fachada es de estilo neo-románico y neogótico bizantino. La congregación francesa de Jesus y Maria llegan a chile el 13 de mayo de 1834 a bordo de la barca "Sylphide" procedentes de Bordeaux.

En 1897 es colocada la primera piedra de la capilla a cargo de los arquitectos hermanos Bliederhaüser. El terremoto de 1906 causa importantes daños a su torre, que fue reparada por Albert Sieger.

Su primera capilla se levantó en el año 1856 en la quebrada de San Agustín, situación que se mantuvo hasta que, en 1868, se adquirió el sitio que ocupaba la iglesia unión en calle Condell y bajo la dirección del arquitecto John Livingstone fue inaugurada el 8 de octubre de 1869.

Comenzada a construir en 1899 e inaugurada en 1901 . El proyecto es original del profesional Nicanor Marambio y como director de la obra de desempeña Hermógenes Mardones.