Establecido en 1940 los límites de nuestra soberanía dentro del casquete polar antártico, por El Supremo Gobierno, correspondiendo a la Armada concertar la ocupación efectiva de ese territorio.
Con ese objeto se preparó una expedición al mando del Comodoro Federico Guesalaga Toro, quien eligió la isla Greenwich para levantar la base. En sólo 29 días se hicieron las construcciones necesarias; se trabajó hasta 20 horas diarias, aprovechando la larga duración de la luz solar, con bajas temperaturas. El 6 de febrero de 1947, se llevó a efecto la inaguración de la estación meteorológica y radiotelegráfica erigida por la Armada de Chile en Puerto Soberanía.
Esta se constituyó en la primera base antártica de nuestro país, que más tarde recibió el nombre de Base Naval Antártica "ARTURO PRAT".
Con fecha 23 de Febrero del 2004 y luego de 57 años de operaciones la Base Capitán Arturo Prat fue oficialmente cerrada.

En el 2007 comienzan los trabajos para la reapertura de la Base.

Tras 29 días de trabajo fue izado el pabellón nacional en la Estación Naval y Meteorológica "Arturo Prat”, cuya primera dotación de 6 hombre cumplió esa primera comisión durante un año entero antes de ser relevados. La base Naval será reabierta en marzo del 2008. Sesenta años después, una nueva dotación, compuesta por 10 hombres al mando del Capitán de Navío OM Carlos Fernández Liberona, Comandante de la Base, llegó hasta esa zona a fines de diciembre de 2007. En conjunto con la Brigada de Reparaciones Antártica, el grupo realizará las tareas de recuperación de la Base, la que será inaugurada oficialmente en el mes de marzo. A partir de marzo se destinará una dotación permanente de la Armada en la Base, la que tendrá como misión reestablecer la soberanía en la Antártica, con una Capitanía de Puerto, además de reactivar la Estación Meteorológica y Científica, la que entrará en funcionamiento a principios de 2009.